工程變更的處理程序：

（1）建設單位需對原工程設計進行變更，根據《建設工程施工合同文本》的規(guī)定，發(fā)包方應不遲于變更前14天以書面形式向承包方發(fā)出變更通知。變更超過原設計標準或批準的建設規(guī)模時，須經原規(guī)劃管理部門和其他有關部門審查批準，并由原設計單位提供變更的相應圖紙和說明。發(fā)包方辦妥上述事項后，承包方根據發(fā)包方變更通知并按工程師要求進行變更。因變更導致合同價款的增減及造成的承包方損失，由發(fā)包方承擔，延誤的工期相應順延。

合同履行中發(fā)包方要求變更工程質量標準及發(fā)生其他實質性變更，由雙方協(xié)商解決。

（2）承包商（施工合同中的乙方）要求對工程進行變更，具體規(guī)定如下：

1）施工中乙方不得擅自對原工程設計進行變更。因乙方擅自變更設計發(fā)生的費用和由此導致甲方的直接損失，由乙方承擔，延誤的工期不予順延。

2）乙方在施工中提出的合理化建議涉及設計圖紙或施工組織設計的更改及對原材料、設備的換用，須經工程師同意。未經同意擅自更改或換用時，乙方承擔由此發(fā)生的費用，并賠償甲方的有關損失，延誤的工期不予順延。

3）工程師同意采用乙方的合理化建議，所發(fā)生的費用和獲得的收益，甲乙雙方另行約定分擔或分享。

工程變更程序一般由合同規(guī)定，最好的變更程序是在變更執(zhí)行前，雙方就辦理工程變更中涉及的費用增加和造成損失的補償協(xié)議，以免因費用補償的爭議影響工程的進度。