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CPHI制藥在線 資訊 清華大學最新Cell論文,李丕龍團隊等揭示X染色體失活基因的傳播行為和受限擴散的生物物理學基礎

清華大學最新Cell論文,李丕龍團隊等揭示X染色體失活基因的傳播行為和受限擴散的生物物理學基礎

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來源:生物世界
  2025-01-17
2025 年 1 月 16 日,清華大學李丕龍團隊聯(lián)合哈佛大學醫(yī)學院等團隊在《Cell》發(fā)表論文,解析了 X - ist 的傳播行為和受限擴散的生物物理學基礎,發(fā)現 HNRNPK 凝聚體中的相變使 X - ist 能在局部濃縮沉默因子并在染色體內部通道擴散。

男性與女性之間核心差異在于性染色體的不同,女性擁有兩條 X 染色體(XX),男性則有一條 X 染色體以及與之配對的一條 Y 染色體(XY)。X 染色體攜帶了數百個編碼蛋白的基因,而 Y 染色體很小,只攜帶了少量編碼蛋白的基因,女性比男性多了一條 X 染色體,這可能會導致女性細胞中蛋白質表達增加,這種過量的蛋白表達將是致命的。

而大自然設計了一個聰明而又復雜的方法來解決這一問題——X 染色體失活,在胚胎發(fā)育早期,每個細胞都會獨立做出決定,隨機關閉兩個 X 染色體中的一個,從而保證了女性和男性的細胞中表達蛋白的基因數量大體上相同。

這種 X 染色體失活是通過一個只在雌性細胞中表達的長鏈非編碼 RNA(lncRNA)——X-ist 在 X 染色體上順式受限傳播的實現的,然而,哪些因素控制著 X-ist 的這種傳播行為,它為何沒有向其他染色體擴散?這些問題仍有待解答。

2025年1月16日,清華大學李丕龍團隊聯(lián)合哈佛大學醫(yī)學院/麻省總醫(yī)院 Jeannie T. Lee 團隊,在國際頂尖學術期刊 Cell 上發(fā)表了題為:A biophysical basis for the spreading behavior and limited diffusion of X-ist 的研究論文。該研究解析了 X-ist 的傳播行為和受限擴散的生物物理學基礎。

當 X-ist RNA 在染色體上順式傳播時,啟動了 X 染色體失活。在這項最新研究中,研究團隊揭示了其順式受限擴散的生物物理學基礎。

國際頂尖學術期刊 Cell

X-ist RNA 與核不均一核糖核蛋白 K(HNRNPK)共同驅動液-液相分離(LLPS),從而將染色體包裹起來。HNRNPK 液滴將 X-ist 拉入并內化。一旦內化,X-ist 誘導進一步的相變,并“軟化” HNRNPK 液滴。X-ist 在體外能夠改變凝聚體的可變形性、黏附性和潤濕性。其他與 X-ist 相互作用的蛋白質被內化并被捕獲在液滴中,導致 X-ist 和蛋白伴侶在凝聚體中濃度增加。研究團隊將液-液相分離(LLPS)歸因于 HNRNPK 的 RGG 和 X-ist 的 RepB 基序,突變這些基序會導致 X-ist 擴散,破壞多梳募集,并阻止 X-ist 遷移所需的染色體區(qū)室混合。

液-液相分離

該研究的核心發(fā)現:

  • HNRNPK 相分離形成凝聚體,作用于 X-ist 使其 RNA 內化;
  • X-ist RNA 通過軟化 HNRNPK 凝聚體誘導進一步的相變;
  • 其他沉默因子被內化、困住并濃縮在液滴中;
  • 液滴的變形性和黏附性的增強使 X-ist 能夠在染色體中順式擴散。

因此,研究團隊的出結論——HNRNPK 凝聚體中的相變,使 X-ist 能夠在局部濃縮沉默因子,并通過 HNRNPK 包裹的染色體內部通道進行擴散。

論文鏈接:

https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(24)01417-X

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